VPREB1 |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
2H32, 2H3N, 3BJ9 |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | VPREB1, IGI, IGVPB, VPREB, CD179a, pre-B lymphocyte 1, V-set pre-B cell surrogate light chain 1 |
---|
Внешние ID | OMIM: 605141 MGI: 98936 HomoloGene: 84741 GeneCards: VPREB1 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
| Хр. | 16-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 16 A3|16 10.46 cM | Начало | 16,686,267 bp[2] |
---|
Конец | 16,688,707 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
| Наибольшая экспрессия в | - choroid plexus of fourth ventricle
|
| |
|
---|
BioGPS | | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 22: 22.24 – 22.25 Mb | Chr 16: 16.69 – 16.69 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
Йота-цепь иммуноглобулина (англ. Immunoglobulin iota chain; CD179a) — мембранный белок суперсемейства иммуноглобулинов. Продукт гена человека VPREB1[5][6].
Функции
VpreB/CD179a — йота (ι)-цепь иммуноглобулина, полипептид, состоящий из 126 аминокислот, молекулярная масса 16-18 кДа. Экспрессирован на ранних стадиях развития B-лимфоцитов, а именно на проB-клетках и ранних преВ-клетках. Белок имеет структуру, сходную с иммуноглобулиновым доменом V типа, но не содержит последний бета-лист (бета-лист 7) типичного Ig V домена. Вместо этого C-конец белка не похож ни на один другой. VpreB/CD179a нековалентно ассоциирован с IGLL1/CD179b, образуя структуру, подобную лёгкой цепи иммуноглобулинов, которую называют суррогатной лёгкой цепью либо псевдолёгкой цепью. В этом комплексе неполный Ig V домен VpreB/CD179a дополняется экстра-бета-листом 7 молекулы IGLL1/CD179b. На поверхности ранних преВ-клеток гетеродимер CD179a/CD179b связан дисульфидной связью с мембранной тяжёлой мю-цепью в ассоциации со вспомогательным белковым гетеродимером Igα/Igβ (CD79a/CD79b). В результате этот комплекс формирует пре-B-клеточный рецептор. Хотя патологии, ассоциированные с CD179a ещё не описаны, недостаточность других компонентов рецептора, включая CD179b, Ig тяжёлую мю-цепь и CD79a, приводит к тяжёлому нарушению развития B-клеток и агаммаглобулинемии у человека. Пре-B-клеточный рецептор передаёт сигнал для (1) клеточной пролиферации, дифференциации проB- в преB-клетки; (2) аллельного исключения в генном локусе Ig тяжёлых цепей и (3) стимуляции V(D)J-рекомбинации Ig лёгких цепей. Таким образом, пре-B-клеточный рецептор функционирует как чек-пойнт ранних этапов развития B-клеток для контроля продукции Ig тяжёлых мю-цепей за счёт функциональной рекомбинации генов тяжёлых цепей, а также способности тяжёлых цепей связываться с лёгкими цепями[6].
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000169575 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000059305 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Bauer SR, Huebner K, Budarf M, Finan J, Erikson J, Emanuel BS, Nowell PC, Croce CM, Melchers F (Nov 1988). "The human Vpre B gene is located on chromosome 22 near a cluster of V lambda gene segments". Immunogenetics. 28 (5): 328—33. doi:10.1007/BF00364231. PMID 3139558. S2CID 6981867.
- ↑ 1 2 Entrez Gene: VPREB1 pre-B lymphocyte gene 1 (неопр.).
Литература
- Tsubata T, Reth M (September 1990). "The products of pre-B cell-specific genes (lambda 5 and VpreB) and the immunoglobulin mu chain form a complex that is transported onto the cell surface". The Journal of Experimental Medicine. 172 (3): 973—6. doi:10.1084/jem.172.3.973. PMC 2188549. PMID 2117639.
- Bauer SR, Kudo A, Melchers F (January 1988). "Structure and pre-B lymphocyte restricted expression of the VpreB in humans and conservation of its structure in other mammalian species". The EMBO Journal. 7 (1): 111—6. doi:10.1002/j.1460-2075.1988.tb02789.x. PMC 454222. PMID 3258819.
- Guelpa-Fonlupt V, Bossy D, Alzari P, Fumoux F, Fougereau M, Schiff C (October 1994). "The human pre-B cell receptor: structural constraints for a tentative model of the pseudo-light (psi L) chain". Molecular Immunology. 31 (14): 1099—108. doi:10.1016/0161-5890(94)90105-8. PMID 7935499.
- Ohnishi K, Takemori T (November 1994). "Molecular components and assembly of mu.surrogate light chain complexes in pre-B cell lines". The Journal of Biological Chemistry. 269 (45): 28347—53. PMID 7961773.
- Guelpa-Fonlupt V, Tonnelle C, Blaise D, Fougereau M, Fumoux F (January 1994). "Discrete early pro-B and pre-B stages in normal human bone marrow as defined by surface pseudo-light chain expression". European Journal of Immunology. 24 (1): 257—64. doi:10.1002/eji.1830240140. PMID 8020565. S2CID 20176205.
- Bornemann KD, Brewer JW, Perez E, Doerre S, Sita R, Corley RB (March 1997). "Secretion of soluble pre-B cell receptors by pre-B cells". Journal of Immunology. 158 (6): 2551—7. PMID 9058786.
- Kawasaki K, Minoshima S, Nakato E, Shibuya K, Shintani A, Schmeits JL, Wang J, Shimizu N (March 1997). "One-megabase sequence analysis of the human immunoglobulin lambda gene locus". Genome Research. 7 (3): 250—61. doi:10.1101/gr.7.3.250. PMID 9074928.
- Fang T, Smith BP, Roman CA (October 2001). "Conventional and surrogate light chains differentially regulate Ig mu and Dmu heavy chain maturation and surface expression". Journal of Immunology. 167 (7): 3846—57. doi:10.4049/jimmunol.167.7.3846. PMID 11564802.
- Gisler R, Sigvardsson M (May 2002). "The human V-preB promoter is a target for coordinated activation by early B cell factor and E47". Journal of Immunology. 168 (10): 5130—8. doi:10.4049/jimmunol.168.10.5130. PMID 11994467.
- Gauthier L, Rossi B, Roux F, Termine E, Schiff C (October 2002). "Galectin-1 is a stromal cell ligand of the pre-B cell receptor (BCR) implicated in synapse formation between pre-B and stromal cells and in pre-BCR triggering". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (20): 13014—9. Bibcode:2002PNAS...9913014G. doi:10.1073/pnas.202323999. PMC 130578. PMID 12271131.
- Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). "A genome annotation-driven approach to cloning the human ORFeome". Genome Biology. 5 (10): R84. doi:10.1186/gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
{{cite journal}}
: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка) - Rossi B, Espeli M, Schiff C, Gauthier L (July 2006). "Clustering of pre-B cell integrins induces galectin-1-dependent pre-B cell receptor relocalization and activation". Journal of Immunology. 177 (2): 796—803. doi:10.4049/jimmunol.177.2.796. PMID 16818733.
|
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|