XPA |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1D4U, 1XPA, 2JNW | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | XPA, XP1, XPAC, xeroderma pigmentosum, complementation group A, DNA damage recognition and repair factor |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611153 MGI: 99135 HomoloGene: 37298 GeneCards: XPA |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
xeroderma pigmentosum group A[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • protein domain specific binding • protein homodimerization activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • damaged DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • intercellular bridge • DNA replication factor A complex • nucleotide-excision repair factor 1 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • nucleotide-excision repair, DNA incision • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • transcription-coupled nucleotide-excision repair • GO:0001306 response to oxidative stress • cellular response to DNA damage stimulus • response to auditory stimulus • multicellular organism growth • global genome nucleotide-excision repair • response to toxic substance • response to UV • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair • UV-damage excision repair • base-excision repair • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • GO:0100026 Репарація ДНК • УФ-захист • protein localization to nucleus • regulation of autophagy • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 4: 46.16 – 46.2 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
XPA (англ. XPA, DNA damage recognition and repair factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 31 368[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAADGALPE | | AAALEQPAEL | | PASVRASIER | | KRQRALMLRQ | | ARLAARPYSA |
TAAAATGGMA | | NVKAAPKIID | | TGGGFILEEE | | EEEEQKIGKV | | VHQPGPVMEF |
DYVICEECGK | | EFMDSYLMNH | | FDLPTCDNCR | | DADDKHKLIT | | KTEAKQEYLL |
KDCDLEKREP | | PLKFIVKKNP | | HHSQWGDMKL | | YLKLQIVKRS | | LEVWGSQEAL |
EEAKEVRQEN | | REKMKQKKFD | | KKVKELRRAV | | RSSVWKRETI | | VHQHEYGPEE |
NLEDDMYRKT | | CTMCGHELTY | | EKM |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Satokata I., Iwai K., Matsuda T., Okada Y., Tanaka K. (1993). Genomic characterization of the human DNA excision repair-controlling gene XPAC. Gene. 136: 345—348. PMID 8294029 DOI:10.1016/0378-1119(93)90493-M
- He Z., Henricksen L.A., Wold M.S., Ingles C.J. (1995). RPA involvement in the damage-recognition and incision steps of nucleotide excision repair. Nature. 374: 566—569. PMID 7700386 DOI:10.1038/374566a0
- Topping R.S., Myrand S.P., Williams B.L., Albert J.C., States J.C. (1995). Characterization of the human XPA promoter. Gene. 166: 341—342. PMID 8543191 DOI:10.1016/0378-1119(95)00649-4
- Tanaka K. (1993). Molecular analysis of Xeroderma pigmentosum group A gene. Jpn. J. Hum. Genet. 38: 1—14. PMID 8504220 DOI:10.1007/BF01891230
- Cleaver J.E., Thompson L.H., Richardson A.S., States J.C. (1999). A summary of mutations in the UV-sensitive disorders: xeroderma pigmentosum, Cockayne syndrome, and trichothiodystrophy. Hum. Mutat. 14: 9—22. PMID 10447254 DOI:10.1002/(SICI)1098-1004(1999)14:1<9::AID-HUMU2>3.0.CO;2-6
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з XPA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12814 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P23025 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |